Genom att integrera EU-missionerna som en av regionens specialiseringar har Blekinge gjort dem till en central del av sin forsknings- och innovationsstrategi för smart specialisering. 

Bakgrunden är att regionen insåg vikten av att integrera hållbarhet och klimatförändringar i sin Smart specialiseringsstrategi, och därmed kombinera ekonomisk utveckling med hållbarhet. Dessutom länkar flera av EU-missionerna till regionens utpekade specialiseringar – Teknik (digitalisering och smartare samhällen) och Smart industri (marinteknik).

Region Blekinge ser missionerna som en effektiv metod i det regionala arbetet för att adressera olika samhällsutmaningar, eftersom det främjar utmaningsdriven innovation och samverkan mellan intressenter från olika sektorer för att utveckla lösningar.